Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms