Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Abcf3Q8K268 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Abcf3Q8K268 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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