Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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SbsnQ8CIT9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms