Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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