Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms