Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms