Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Yod1Q8CB27 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms