Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Atg4aQ8C9S8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Atg4aQ8C9S8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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