Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NcaphQ8C156 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcaphQ8C156 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms