Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek11Q8C0Q4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms