Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Snx16Q8C080 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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