Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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