Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Snx17Q8BVL3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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