Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms