Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cxcl16Q8BSU2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cxcl16Q8BSU2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cxcl16Q8BSU2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cxcl16Q8BSU2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms