Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik4Q8BMF5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms