Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp4f39Q8BGU0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms