Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a8Q8BFU8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms