Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc172Q810N9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms