Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms