Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm2Q80W85 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm2Q80W85 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms