Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms