Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf7ipQ7TT18 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms