Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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