Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms