Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms