Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb1Q6NXM2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms