Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms