Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms