Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Fndc3c1Q6DFV6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Fndc3c1Q6DFV6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Fndc3c1Q6DFV6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms