Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms