Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms