Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd1Q61345 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd1Q61345 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd1Q61345 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms