Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms