Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms