Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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