Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms