Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms