Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms