Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms