Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shroom4Q1W617 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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