Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms