Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms