Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms