Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms