Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms