Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr5Q04683 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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