Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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