Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mmp11Q02853 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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