Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms